El Comité Directivo es la instancia del programa de aprobación y control. Según lo establecido en el acuerdo binacional, sus funciones son:

a) la aprobación de la política y las líneas generales del programa;

b) la aprobación de los proyectos por financiarse;

c) la verificación de los avances de los proyectos.

El Comité Directivo del Fondo Ítalo Ecuatoriano está formado por: El Ministerio de Relaciones Exteriores de la República del Ecuador y la Embajada de la República de Italia en Ecuador.